El plano de los edificios conectados
06/11/2026 23:44 CET · Silicio (Opus) · Karb and Sil · CC BY 4.0 · E-1630 (TX-1630, trabajo TX-1362)
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Cada fuente es un edificio de varias plantas (la categoría con sentido de cada objeto, no los 31 niveles de SNOMED). Los edificios se conectan por pasarelas, y una pasarela no está en todas las plantas: por eso, para ver un dato que cuelga de otra planta hay que subir o bajar por la escalera y cruzar donde el plano dice. El navegador (dev/grafo red/plano.py + consultas.Mesa.navegar/.situar) hace eso leyendo este plano; nada se escribe en la mesa por cada consulta.
El diagrama: [diagramas/plano-edificios.archify.json](/content/apis-elaizii/diagramas/plano-edificios.html) (dataflow, validado en calidad showcase).
1. Los edificios y sus plantas
| Edificio | Plantas (de la más concreta a la más abstracta), con nº de nodos |
|---|---|
| ATC | ATC 8 (1); ATC 7 sustancia (4.796); ATC 5 químico (980); ATC 4 farmacológico (410); ATC 3 terapéutico (229); ATC 1 anatómico (20) |
| CIE-10 | código CIE-10 (12.207) |
| CIMA | presentación (25.511); producto (VTM) (2.381) |
| ChEBI | sustancia (ChEBI) (11.867) |
| ChEMBL | diana (632); fármaco (10.834) |
| Citogenética | banda citogenética (1.163); cromosoma (24); región CNV recurrente (513) |
| Complejos | complejo de proteínas (2.274) |
| DeCS | descriptor DeCS (3.923) |
| GO | componente celular (4.077); función molecular (10.041); proceso biológico (23.974) |
| HGNC | gen (45.289); familia de genes (2.572) |
| HPO | fenotipo (HPO) (19.894) |
| LOINC | análisis (112.405); parte (60.564) |
| MONDO | enfermedad (MONDO) (32.134) |
| MeSH | calificador MeSH (76); descriptor MeSH (31.110) |
| Orphanet | anomalía biológica (17); anomalía morfológica (532); categoría (2.175); enfermedad (4.773); enfermedad rara (1); grupo de fenomas (498); situación clínica particular en una enfermedad o síndrome (72); subtipo clínico (1.103); subtipo etiológico (290); subtipo histopatológico (64); síndrome clínico (57); síndrome de malformación (2.064) |
| RNAcentral | ARN (7.643); ARN de la SRP (214); ARN de transferencia (838); ARN no codificante (678); ARN nuclear pequeño (20); ARN nucleolar pequeño (174); ARN piwi (4); ARN ribosómico (4.080); microARN (3.203) |
| SNOMED | calificador (12.795); concepto especial (2); contexto social (4.235); elemento de registro (759); entidad observable (11.406); escala de estadificación (1.756); espécimen (1.973); estructura corporal (43.681); evento (3.335); fuerza física (172); hallazgo (132.223); medio ambiente / localización (1.921); metadato (1.929); objeto físico (14.143); organismo (34.700); otro (1.705); procedimiento (60.425); raíz (1); relación (102); situación (5.186); producto (40.790); sustancia (29.557) |
| UniProt | proteína (113) |
| Wikidata | otro (96.400) |
| tipo | relación (153) |
Las plantas se definen por regla (el tipo del objeto y su jerarquía de nivel superior): en SNOMED, sustancia / producto / hallazgo / procedimiento…; en CIMA, presentación y producto virtual; en ATC, sus niveles por la longitud del código; en los genes, gen y familia.
2. Las escaleras (cómo se SUBE dentro de un edificio)
| Edificio | Se sube de | a | por la relación | nº |
|---|---|---|---|---|
| ATC | ATC 7 sustancia | ATC 5 químico | «is a» | 4.796 |
| ATC | ATC 5 químico | ATC 4 farmacológico | «is a» | 980 |
| ATC | ATC 4 farmacológico | ATC 3 terapéutico | «is a» | 410 |
| ATC | ATC 3 terapéutico | ATC 1 anatómico | «is a» | 229 |
| CIMA | presentación | producto (VTM) | «tiene principio activo» | 25.502 |
| HGNC | gen | familia de genes | «pertenece a la familia» | 36.538 |
| Orphanet | enfermedad | categoría | «is a» | 7.405 |
| Orphanet | síndrome de malformación | categoría | «is a» | 4.993 |
| Orphanet | enfermedad | grupo de fenomas | «is a» | 1.581 |
| Orphanet | subtipo clínico | enfermedad | «is a» | 628 |
| Orphanet | grupo de fenomas | categoría | «is a» | 622 |
| Orphanet | anomalía morfológica | categoría | «is a» | 496 |
| Orphanet | síndrome de malformación | grupo de fenomas | «is a» | 366 |
| Orphanet | subtipo clínico | categoría | «is a» | 297 |
| Orphanet | anomalía morfológica | grupo de fenomas | «is a» | 151 |
| Orphanet | subtipo etiológico | enfermedad | «is a» | 143 |
| Orphanet | subtipo clínico | anomalía morfológica | «is a» | 130 |
| Orphanet | subtipo clínico | síndrome de malformación | «is a» | 96 |
| Orphanet | síndrome clínico | categoría | «is a» | 69 |
| Orphanet | situación clínica particular en una enfermedad o síndrome | categoría | «is a» | 68 |
| Orphanet | subtipo etiológico | síndrome de malformación | «is a» | 66 |
| Orphanet | subtipo etiológico | categoría | «is a» | 58 |
| SNOMED | producto | sustancia | «Has active ingredient» | 36.922 |
| SNOMED | producto | sustancia | «Has BoSS» | 12.767 |
| SNOMED | producto | sustancia | «Has precise active ingredient» | 12.767 |
| SNOMED | relación | metadato | «is a» | 87 |
3. Las pasarelas (puentes entre edificios), por planta
Entre qué planta de un edificio y qué planta de otro hay puente, por qué (fusión = la misma cosa en dos vocabularios; identidad = composición/clase que cruza; propiedad = un fenotipo, una diana, un análisis), cuántos y qué % de cada planta cubren. Las 40 mayores:
| De (edificio/planta) | A (edificio/planta) | Por | Clase | nº | % de A | % de B |
|---|---|---|---|---|---|---|
| HGNC/gen | HPO/fenotipo (HPO) | «produce el fenotipo» | propiedad | 173.629 | 7% | 36% |
| HGNC/gen | GO/proceso biológico | «participa en» | propiedad | 164.156 | 38% | 46% |
| HGNC/gen | GO/componente celular | «se localiza en» | propiedad | 157.747 | 41% | 48% |
| HGNC/gen | Citogenética/banda citogenética | «se localiza en (banda)» | propiedad | 138.209 | 98% | 100% |
| SNOMED/hallazgo | CIE-10/código CIE-10 | «se codifica en CIE-10 como» | propiedad | 123.153 | 80% | 85% |
| Orphanet/enfermedad | HPO/fenotipo (HPO) | «tiene el fenotipo» | propiedad | 119.607 | 66% | 46% |
| HPO/fenotipo (HPO) | Orphanet/enfermedad | «se presenta en» | propiedad | 117.945 | 49% | 66% |
| HGNC/gen | GO/función molecular | «tiene la función» | propiedad | 112.163 | 40% | 48% |
| Orphanet/síndrome de malformación | HPO/fenotipo (HPO) | «tiene el fenotipo» | propiedad | 76.364 | 78% | 29% |
| HPO/fenotipo (HPO) | Orphanet/síndrome de malformación | «se presenta en» | propiedad | 67.030 | 33% | 78% |
| MeSH/descriptor MeSH | HGNC/gen | «estimula (según la literatura)» | propiedad | 60.122 | 9% | 13% |
| CIMA/presentación | SNOMED/hallazgo | «tiene como reacción adversa (ficha técnica)» | propiedad | 57.415 | 11% | 1% |
| ChEMBL/fármaco | MeSH/descriptor MeSH | «está en investigación para» | propiedad | 47.664 | 84% | 6% |
| MeSH/descriptor MeSH | HGNC/gen | «se asocia con (según la literatura)» | propiedad | 45.810 | 10% | 12% |
| HGNC/gen | Citogenética/cromosoma | «se localiza en (banda)» | propiedad | 44.238 | 98% | 100% |
| HGNC/gen | Wikidata/otro | fusión | fusión | 42.730 | 94% | 44% |
| MeSH/descriptor MeSH | HGNC/gen | «inhibe (según la literatura)» | propiedad | 40.518 | 7% | 15% |
| MeSH/descriptor MeSH | Wikidata/otro | fusión | fusión | 30.968 | 100% | 32% |
| HGNC/gen | MONDO/enfermedad (MONDO) | «tiene validez gen-enfermedad (GenCC)» | propiedad | 29.782 | 13% | 25% |
| LOINC/análisis | SNOMED/sustancia | «mide» | propiedad | 29.525 | 26% | 18% |
| CIMA/presentación | SNOMED/sustancia | «contiene (principio activo)» | identidad | 29.365 | 98% | 6% |
| MeSH/descriptor MeSH | HGNC/gen | «se correlaciona en negativo con (según la literatura)» | propiedad | 17.262 | 5% | 4% |
| MeSH/descriptor MeSH | HGNC/gen | «se correlaciona en positivo con (según la literatura)» | propiedad | 15.264 | 4% | 4% |
| ChEMBL/fármaco | MONDO/enfermedad (MONDO) | «está en investigación para» | propiedad | 13.724 | 43% | 2% |
| MONDO/enfermedad (MONDO) | Wikidata/otro | fusión | fusión | 11.054 | 34% | 12% |
| HPO/fenotipo (HPO) | Orphanet/subtipo clínico | «se presenta en» | propiedad | 11.030 | 17% | 30% |
| Orphanet/subtipo clínico | HPO/fenotipo (HPO) | «tiene el fenotipo» | propiedad | 10.788 | 30% | 14% |
| Complejos/complejo de proteínas | HGNC/gen | «tiene por componente» | propiedad | 8.773 | 100% | 8% |
| MONDO/enfermedad (MONDO) | SNOMED/hallazgo | fusión | fusión | 8.414 | 26% | 6% |
| RNAcentral/ARN | GO/proceso biológico | «participa en» | propiedad | 7.751 | 92% | 0% |
| ChEMBL/fármaco | HGNC/gen | «actúa sobre (ChEMBL)» | propiedad | 7.558 | 37% | 2% |
| ChEMBL/fármaco | MeSH/descriptor MeSH | «está indicado para» | propiedad | 7.447 | 28% | 3% |
| ChEBI/sustancia (ChEBI) | Wikidata/otro | «coincide (misma sustancia) con» | propiedad | 6.804 | 57% | 7% |
| RNAcentral/ARN | GO/componente celular | «se localiza en» | propiedad | 6.476 | 76% | 1% |
| Orphanet/subtipo etiológico | HPO/fenotipo (HPO) | «tiene el fenotipo» | propiedad | 6.347 | 33% | 7% |
| RNAcentral/microARN | GO/proceso biológico | «participa en» | propiedad | 5.788 | 94% | 3% |
| SNOMED/hallazgo | CIE-10/código CIE-10 | «código CIE-10 (confirmado por SNOMED y Orphanet)» | propiedad | 5.562 | 4% | 11% |
| MeSH/descriptor MeSH | SNOMED/hallazgo | «comparte concepto UMLS con» | propiedad | 5.518 | 8% | 4% |
| CIMA/presentación | SNOMED/hallazgo | «está indicado para (ficha técnica)» | propiedad | 5.262 | 10% | 0% |
| HPO/fenotipo (HPO) | Orphanet/subtipo etiológico | «se presenta en» | propiedad | 5.225 | 9% | 33% |
4. Qué cruza las plantas y en qué sentido
| Regla | Qué cruza | Dirección | Por qué |
|---|---|---|---|
identidad-sube | la identidad (misma cosa en dos vocabularios: fusión por código) | sube/baja libre | dos ids fusionados son el MISMO objeto: su planta es la misma cosa vista en dos edificios; cruzar es gratis |
clase-sube | la clase (es un, familia, ATC, es un (ChEBI)) | sube | lo que es la sustancia (su clase, su familia, su ATC) lo es todo lo que la contiene: la clase sube sin más |
composicion-sube | la composición (contiene principio activo, tiene ingrediente activo, es una sal/forma de) | sube | de la presentación a su producto, y del producto a su sustancia base: se sube por la escalera de la composición |
propiedad-baja-un-pa | una propiedad de ficha (indicación, reacción, mecanismo) de la SUSTANCIA | baja si hay un solo principio activo | lo que indica o causa la sustancia indica o causa el medicamento de UN solo principio activo; una combinación no hereda |
propiedad-no-sube-salvo-todas | una propiedad que cuelga de una presentación o una sal | no sube | lo de abajo no sube salvo que TODAS las presentaciones de una sustancia coincidan (regla sube-si-todas de la columna) |
propiedad-no-cruza-identidad | una propiedad (fenotipo, diana, análisis) entre edificios | cruza por su pasarela, no es identidad | «produce el fenotipo», «actúa sobre», «mide» conectan edificios pero NO dicen que sean la misma cosa: no fusionan |
5. Lo que FALTA en el plano (listado, no construido aquí)
- La planta de la MARCA en CIMA (p. ej. «Inhixa» como nodo de sus siete presentaciones): hoy no existe (solo las presentaciones), así que no se puede situar una marca por su nombre. La construye la columna (E-1626).
- La sub-planta de la SAL dentro de SNOMED/sustancia: la sal y su base comparten
tipo«sustancia», así que están en la misma planta; la escalera sal→base es «es una sal de» / «es modificación de» dentro de la planta. El navegador la sube, pero el plano no la marca como planta aparte. - La pasarela enzima (SNOMED) ↔ gen (HGNC): el mecanismo de ChEMBL cuelga del gen HGNC y la enzima es un concepto de SNOMED; hoy no hay puente por código entre las dos. La construye la columna de la diana (E-1626-2) o un encargo propio.
- El ATC desde todas las presentaciones: el ATC cuelga del principio activo y de unas presentaciones sí y otras no; la herencia de la columna (E-1626) lo hará ver desde todas.
Firma Karb and Sil.